Auch wenn es metabolisiert wird, Mercaptopurin, nur winzige Mengen dieser Droge wurden in der Muttermilch nachgewiesen (4 - 18 Mikrogramm/liter). Bei einigen gestillten Säuglingen von Müttern, die mit Azathioprin behandelt konnte nicht erkannt werden das Blut noch Nebenwirkungen gefunden wurden. Langfristige Infektionskrankheiten wurden nicht häufiger bei exponierten Kindern. Exposition würde minimiert werden, wenn die Pflege fortgesetzt wird 3 Stunden nach der letzten Dosis.